Вхід
Инструкции для пользователей
Пример запуска Gromacs на кластере СКИТ
В качестве примера используем gmxbench с домашнего сайта gromacs.
Компиляция и запуск MPI приложений на разделе scit4
Как можно выполнить компиляцию и запуск MPI версии программ с помощью MVAPICH2 на разделе кластера scit4.
Запуск задач на узлах с заданным количеством ядер
Иногда нужно запустить задачу не на любых узлах, а только с определенным количеством ядер, например, 4-ядерных.
Запуск задач на OpenCL на гибридных узлах кластера СКИТ
На кластере СКИТ установлен стандартный AMD APP SDK. Продемонстрируем, как компилировать задачи на OpenCL, на примере из второй главы "AMD Accelerated Parallel Processing OpenCL(tm) Programming Guide".
Инструкция Slurm для пользователя. Краткое руководство по запуску
Простая Linux Утилита для Управления Ресурсами (SLURM) - это открытая, надежная и хорошо масштабируемая система управления ресурсами кластера с планировщиком задач, применяемая как для больших, так и для малых Linux-кластеров.
Инструкция для пользователей Firefly
У нас есть профиль запуска для пакета pc-gamess (firefly), но к сожалению лицензионная политика разработчика требует отдельной регистрации от каждого пользователя.
Интеллектуальный пакет PREDICTOR. Руководство пользователя
Назначение библиотеки Predictor – статистическое прогнозирование в бизнес-расчетах, например, с целью анализа объемов предполагаемых продаж, выбора ассортимента товаров и услуг по спрогнозированным ценам, удовлетворения потребностей в численности персонала.
Доступ к кластеру через Secure Shell (SSH)
Интерфейс доступа к кластеру через SSH открывает для опытного пользователя наиболее широкие возможности по использованию суперкомпьютера.
Режим MPI-None пакетной обработки данных
Режим MPI-None запуска задачи позволяет организовать запуск не-MPI программ и сформировать пакет из нескольких последовательных операций над данными.
Сигнал 15 завершения работы задачи (SIGTERM 15)
Покажем причину возникновения сигнала 15 SIGTERM на примере.
Порядок сообщения про ошибки в работе кластера
Если есть ошибки в работе комплекса СКИТ, мы будем признательны, если Вы нам об этом сообщите почте. Для того, чтобы представленой информацией можно было еффективно воспользоваться, она должна содержать ответы ряд вопросов.
Файловое хранилище для грид-задач
В комплексе СКИТ развернуто ПО для хранения входных данных и результатов расчетов грид-задач (Grid-Storage) на основе gridFTP.
На данный момент сервис находится в тестовой експлуатации.
Для активации обращайтесь к администраторам кластера.
FTP-сервер
На кластерном комплексе СКИТ установлен FTP-сервис.
Сервис предназначен для загрузки исходных данных и выгрузки результатов расчетов особо большого размера.
Так как ftp не зашищен шифрованием потока передаваемых данных, передача происходит быстрее, занимает меньше ресурсов процессора.
Исполнение задач на кластере
Как подготовить и как управлять исполнением задач